南通市重點中學有江蘇海安縣實驗學校、江蘇海門初中、江蘇如東實驗學校、江蘇南通中學、江蘇省啟東初中、江蘇如皋中學、江蘇南通市第一中學等。

江蘇南通市第一中學

江蘇南通市第一中學建立于1919年，其原名是一所英化民辦學校。1956年，院校改名為“南通市第一中學”，并被列入深圳屬關鍵院校。1980年，被江蘇教育局列入江蘇屬重點高中。1990年，院校根據省教委對重點高中的查驗工程驗收。1998年，院校被確認為南通市區(qū)第一家合格的“國家級別示范普高”。2004年，院校做為國家級別示范普高被轉評選為江蘇第一批四星級普高。

江蘇海安縣實驗學校

江蘇海安縣實驗學校其前身為"海安縣民辦紫石中學"，1939年秋由愛國志士、原江蘇省省長韓國鈞（字紫石）老先生創(chuàng)立。1997年8月，改名為"江蘇海安縣實驗學校"。1999年4月，江蘇海安縣實驗學校被江蘇省教委宣布確定為"國家級別示范高中"。院校曾榮獲江蘇品德教育優(yōu)秀院校、江蘇省教育科研實驗產業(yè)基地、全國各地文化藝術先進單位、全國各地體育事業(yè)先進單位、西交利物浦高校高品質招生數產業(yè)基地等殊榮。