上海海事大學是一所以航運、物流、海洋為特色，具有工學、管理學、經濟學、法學、文學、理學和藝術學等學科門類的多科性大學。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協(xié)議，共建上海海事大學。

實行校院二級管理體制，現設有商船學院、交通運輸學院、經濟管理學院(設亞洲郵輪學院)、物流工程學院(設中荷機電工程學院)、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋科學與工程學院、文理學院(設馬克思主義學院)、徐悲鴻藝術學院、物流科學與工程研究院、上海高級國際航運學院等二級辦學部門。在21000余名學生中，有本科生17000余人，各類在校研究生3500余人，留學生700余名。在1100余名專任教師中，有教授156名，具有博士學位的教師比例約62.4%。學校致力于培養(yǎng)國家航運業(yè)所需要的各級各類專門人才，已向全國港航企事業(yè)單位及政府部門輸送了大量畢業(yè)生，被譽為“高級航運人才的搖籃”。

學校設有2個博士后科研流動站(交通運輸工程、電氣工程)，2個一級學科博士點(交通運輸工程、管理科學工程)，19個二級學科博士點，13個一級學科碩士學位授權點，59個二級學科碩士學位授權點，6個專業(yè)學位碩士授權點，10個工程碩士點，47個本科專業(yè)。擁有11個省部級重點研究基地?，F有1個國家重點(培育)學科，1個上海市高峰學科，2個上海市高原學科，9個部市級重點學科，工程學科進入ESI全球前1%。5個國家級特色專業(yè)，1個國家級綜合改革試點專業(yè)，6個教育部卓越工程師教育培養(yǎng)計劃專業(yè)，17個上海市本科教育高地?，F有2個國家級實驗教學示范中心，2個國家級虛擬仿真實驗教學示范中心，5個國家級實踐教學示范中心，1個全國示范性工程專業(yè)學位研究生聯合培養(yǎng)基地。設有水上訓練中心，擁有萬噸級集裝箱教學實習船“育鋒”輪，4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪。