該校藥學(xué)系創(chuàng)建于1975年。在2006年全省47個(gè)碩士點(diǎn)檢查評(píng)估中，該碩士點(diǎn)獲總分第一。中藥生藥學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局西部重點(diǎn)學(xué)科，中藥生藥實(shí)驗(yàn)室為貴州省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。學(xué)院藥學(xué)系的機(jī)構(gòu)和教學(xué)人才。

該系有教學(xué)機(jī)構(gòu)9個(gè)，科研機(jī)構(gòu)3個(gè)，教學(xué)、科研實(shí)驗(yàn)室4個(gè)，教學(xué)、科研儀器設(shè)備值近1400萬(wàn)元。

現(xiàn)有教學(xué)科研人員100余人，其中正教授20人，副教授30人;國(guó)務(wù)院和省政府特殊津貼者專家4人，省管專家2人，全國(guó)名老中藥專家?guī)煶谐鰩?人。省部級(jí)及院級(jí)學(xué)科帶頭人3人，中青年學(xué)術(shù)骨干4人，博士生導(dǎo)師 2人，碩士生導(dǎo)師 21人。

學(xué)院藥學(xué)系獲獎(jiǎng)。

該系部教師近年來(lái)發(fā)表論文500余篇，主編和參編的專著、教材45部，開發(fā)成功、投產(chǎn)的新藥及保健藥品46個(gè)；其中，獲省部級(jí)獎(jiǎng)10項(xiàng)，其它獲獎(jiǎng)9項(xiàng)，發(fā)明專利3項(xiàng)，成果轉(zhuǎn)讓5項(xiàng)，科研成果被采用11項(xiàng)，創(chuàng)直接經(jīng)濟(jì)效益1740多萬(wàn)元。

該系還承擔(dān)有國(guó)家自然基金、國(guó)家中醫(yī)藥管理局、省中藥現(xiàn)代化、省長(zhǎng)基金、省科技廳等55項(xiàng)課題。中藥學(xué)（含中藥方向、營(yíng)銷方向、分析方向、涉外方向、苗藥方向）、藥物制劑、制藥工程等專業(yè)設(shè)于該系。

目前，該系已經(jīng)成為貴州省中藥產(chǎn)業(yè)現(xiàn)代化人才培養(yǎng)和科研開發(fā)的重要基地。