實行校院二級管理體制，現(xiàn)設有商船學院、交通運輸學院、經(jīng)濟管理學院、物流工程學院(設中荷機電工程學院)、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋科學與工程學院、文理學院(設徐悲鴻藝術(shù)學院)、科學研究院、上海高級國際航運學院等二級辦學部門。

學校致力于培養(yǎng)國家航運業(yè)所需要的各級各類專門人才，已向全國港航企事業(yè)單位及政府部門輸送了大量畢業(yè)生，被譽為“高級航運物流人才的搖籃”。